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小卓的壁橱

Wir mussen wissen, wir werden wissen.
February 18

闭门修炼

我想忘记一个数字。
我想做一件事情。想做好。
November 22

Random Talk and Random Walk

为什么要让叶子铺满地,而不让大地裹着树呢。那样,多暖和哦,可是谁会有6374公里厚的被子呢?幻想家有,诗人也有。诗人和我都有一个梦想,要让太阳做我们的暖手袋,让盲人笑,让地球变干净,让风变暖和,这样我们就不用带手套了!手会亲吻它遇到的每一个孩子,有他也有她。
 
他对Higgs粒子说,我得到了你!Higgs悄悄对她说,所有人都不知道,我其实是lesbian,我喜欢你。她不喜欢第五公设,只爱在天津的第五大道上吃小吃,再俏皮的话也说不过她,无聊透顶的才是他。他念咒语:我要风趣。风说,我不去。
 
风等不到诗人,撒娇了,生气了,把诗人写的诗都扔到火里。火受了委屈,去找高雄市长评理,人家不理,说大陆正在空中管制呢,这事儿你只能去问阿扁。见到阿扁,他横刀立马厉声道,我这忙着下乡,你还是上访去吧。火好难过,可是哭不出来,因为眼泪一流出来就蒸发掉了。
 
诗人去了西藏,身无分文。风吹到了南海,微波荡漾。我去了非洲,懵懂无知。他和她在地下一万三千公里举办了婚礼——正好是世界的另一端。两人倒立着交换了戒指。神父惊呼,这个世界,颠覆了!
September 17

live to read

我最近是越忙越喜欢看闲书,尤其迷上了两本:
East and West, by Chris Pattern(
彭定康)

伟大的书, by 邓比

今天去听组会,发现有些实验室规定研究生ggjj们的工作时间是9:30am-10:30pm,很过分。都没时间看书了。生活要过得悠闲。
September 14

我有一颗质粒, 亦绿亦白

从明天起, 做一个幸福的细菌
酶切, 沉淀, 连接转化
从明天起, 关心EcoRI和PstI
我有一颗质粒, 双向抑制, 亦绿亦白

从明天起, 和每一个基因通信
告诉他们我的幸福
那UV的闪电告诉我的
我将告诉每一个蛋白质

给每一对引物每一颗质粒取一个温暖的名字
培养基, 我也为你祝福
愿PCR有一条灿烂的亮斑
愿载体和片段终成眷属
愿E.coli在尘世获得幸福
我只愿有一颗质粒, 亦绿亦白
 
无聊一下,^_^
海子的fans们不要打我。
September 11

光线的由来

光本是波,何以有了光线呢?

这是因为把局部的光场近似成了平面波。平面波有两大特点,一是振幅恒定,二是相位梯度恒定。若光场满足振幅近似恒定,相位梯度亦近似恒定,则可把光近似为平面波处理。进一步给这个“近似”下个定义,只要光场的振幅变化速率远小于相位变化速率,相位梯度的变化速率远小于相位的变化速率,光场就可近似为平面光波。

这么说来,通常画光路图的时候人们常常在犯一个小错。通常会作两条或多条光线的交点来求像点,这是有问题的。在像点附近,相位梯度的变化在空间各点变化较大,此时已经不能认为有光线了。像点附近还会发生干涉现象。(rpwang课程笔记整理)
September 04

where we are & where we are head for

Dear Switch/Count team members,

In this email will be a brief statement of our current situation. It's meant to be a reference that you may want to look at while you are in the lab, as well as a stimulus for discussion while you are absent.

******************************
* where we are are head for
******************************

Our present road map can be summarized as below:

Step 1a. PCR promoter cI434OR21 & cI434OR321 (noted as 434OR), assemble it into the switch plasmid (pSB3K3 from I7100, Kan+).
Product: 434OR on pSB3K3

Step 1b. PCR gene cI, assemble it into the switch plasmid obtained above.
Product: cI_434OR on pSB3K3

Step 2a. PCR gene EGFP, assemble it into the the switch plasmid.
Product: EGFP on pSB3K3

Step 2b. PCR gene cI434, assemble it into the switch plasmid obtained above.
Product: cI434_EGFP on pSB3K3

(Step 1 and 2 will go in parallel.)

Step 3. Cut cI_434OR from the product of Step 1b, assemble it into the product of Step 2b.
Product: cI_434OR_cI434_EGFP on pSB3K3

(In principle, this plasmid potentially has a bistable property. That's our minimum goal.)

Step 4. PCR gene lacIq, assemble it into the product of Step 3.
Product: lacIq_cI_434OR_cI434_EGFP on pSB3K3

(This forms a complete switch plasmid. This is our intermediate goal.)

While Step 1-4 is on its way, we will go in parallel to build up the double repressor plasmid:

Step 1'. PCR cIind-, assemble it into the double repressor plasmid (pSB1A3 from I13521, Amp+).
Product: cIind- on pSB1A3

Step 2'. PCR any one of the double repressor promoter (noted as pDR ), assemble it into the plasmid obtained above.
Product: pDR_cIind- on pSB1A3

(Products of Step 4 and Step 2' form a complete switch system, at least in theory. This is our advanced goal. It would be a miracle if we could do more than that in one week.)

**************************
* where we are
**************************

As till tonight, we have done the following:

* As for PCR, we have successfully obtained the PCR product of 434OR, cI(both SDA & SDC), cI434(both SDcro & SDC) and EGFP(SDY) . They are ready for digestion (some are already digested).
That's all we need for the minimum goal.

* However, the PCR of lacIq and cIind- failed (for twice, once using LA taq, the other case using Ex taq).
The template for lacIq is the genome of some school of bacterial, that for cIind- is pLC003. Both templates are provided by LCB. I suspect there is either a problem with the templates themselves, or with the amount of template I use in the PCR system.

* We have successfully digested pSB1A3 (from I13521) with EcoRI & PstI.

* However, the digestion of pSB3K3 (from I7100) with EcoRI & PstI is problematic . Some plasmids are cut twice (which is good), yet some plasmids are only cut once (which is bad).
CCY will mini-prep pSB3K3 again tonight, followed by a double digestion. Hopefully the digested plasmid will be available for ligation (Step 1a, 2a) tomorrow.

* We have digested the PCR product of 434OR & EGFP with EcoRI & PstI. They are ready for ligation with pSB3K3^^(EcoRI/PstI). Though pSB3K3^^ is problematic (and a good one won't be available till tomorrow morning), CCY will do the ligation tonight.

In short, we are still in Step 1a and 2a. Hopefully we can move to 1b and 2b by tomorrow night (only if the ligation tonight is successful).


Best,
Daizhuo




I will write a report of this kind every one or two days & I urge all Switch team members to read it carefully.

It's important that EVERYONE KNOWS WHAT'S HAPPENING IN THE LAB.

Daizhuo

September 01

谷歌宴小记

本是约见小小,却升级成了昨晚ioiforum在谷歌中国小聚,还很荣幸的请到了开复老师做东。我和开复只隔一个位置,心想这地儿还不错。哪知,第一圈自我介绍时,便出了小岔子。在座的大多是学计算机的,就我不一样,开复便问我为什么选物理。我近日谦虚惯了,也没多想,只敷衍说是当时北大物院要我啦便去了么云云。开复听了,皱起眉头,脸也沉下来,语重心长道,没主见是不行的。这可好,怎么能让人家这么批评呢?我立马补上说主要是当时北大动手抢得比较快了(这话不假,清华就是慢了一拍所以才没去的)。开复也蛮给面子,接着话头问,“那好,google也来抢你,你来不来?”

我倒是不买账:“Google啊,还不够水准,Princeton抢我我就去。”这也是实话实说。

开复:“Princeton有什么好的?Princeton的博士我们还不一定要呢。”

我:“Princeton的毕业生也不一定想来Google啊。人家研究的研究,赚钱的赚钱,做投行的就比Google赚钱多嘛。”(瞧这话说的…当时随口编的理由)

开复:“你这光想着赚钱,太没有追求了。”

我决定退守:“不是不是,国内的物理还是不错的,华人在物理上颇有建树,几获诺奖,而北大又是国内物理最好,所以才选择北大物理的。”(小注:南大和科大物理系的同学们不要介意,我入学的那阵子还是我们排第一的)

开复:“这个回答还可以,不过这是第二次回答,已经不算数了。”

我:“前面那个joke一下嘛。”

本想这样交锋算是结束,结果才是第一回合。接下来开复不时的提起Princeton,说那儿读博士(大概他指计算机的),要数据没数据,要应用没应用,都是象牙塔里的赘物,全然不如google云云。每每说起,都还要顾左右而言其他的向我这儿瞟几眼。

我心想我读计算机的话倒可能真喜欢google了。难道我读数学物理你也要把我拦着不成?遂好意决定换个话题,把google给网页做检索和大脑对脑中信息的检索做了一个类比,说自己对这个很感兴趣,以后有打算研究这个方向。

开复这回可不客气:“你为什么要浪费青春写几篇没什么人看的论文?有多少人研究过这些事情,你凭什么知道别人做不出来,你就做得出来呢?”

这话说得暗合我意,只是说得太直白太实在了。我想开复也警觉到了这样打击青年学生不好,所以继续说道:“你如果对这个感兴趣,我推荐你一本书,你去好好看看。书的作者是xxx,Palm的前总裁,名字叫…叫…”他一下子没想起来。

碰巧我读过这本书,便顺口讲出名字:“叫On Intelligence是吧?我看过的!”

开复:“是的。”……第二回合结束。

第三回合的起因是大家谈到谷歌近日和本土的天涯网站的合作,是不是在走市民化路线,有损美国总部高端技术的形象。开复先解释一番(我以为还是颇有道理),随后又反问我们,那你们说,中国本土有哪家高端的网站值得尊敬,值得谷歌合作呢?

全桌沉默不语。我想来想去,符合“最值得尊敬”标准的本土网站,也就只有那一家了。

开复把这个问题翻来覆去问了好几次(起码有45s以上),大家眉来眼去,都不说话。最后还是我说的:

“百度啊!”

开复领着全桌一起笑……吃到后来颇有点“耿耿于怀”,开玩笑的对Allen(他的strategy manager,后来入座在我旁边)讲桌上有个崇拜百度的,让Allen教育教育我。那个汗啊…不过平心而论,我以为百度中文搜索的能力还是好过谷歌的。当给百度伸张正义了,哪天李彦宏同学知道了记得报告我!

总而言之,开复是蛮有意思的老板了,我喜欢,哈哈。谷歌大厨的鹅肝也很是好吃,肉质和烤肉筋串有几分相像,改天我也学学。

(谢谢小小的盛情邀请~ 本文玩笑一下,略有夸张大家莫要当真)


July 19

13亿人的游戏

写完哲学日记已经3点,全然没有睡意,于是看新闻,看到这个背运的男人,这般凝重的表情。定格。
July 04

加油工作!

Work Hard & Play Hard!
June 30

时时乐

Time: Tomorrow Night
Venue: Sizzler Fu Cheng Men/时时乐阜成门
Event: TILIP Reunion
State: Expecting~~

放假了要抓紧时间看书工作!

June 26

Grunbaum's theory

K为n维欧氏空间中的凸集,C为K的重心,过C作超平面分K为两块,则其中较小的一块体积不少于K体积的1/e。

这个月听到的,很pp的定理啊。下边有证明:
http://projecteuclid.org/DPubS/Repository/1.0/Disseminate?view=body&id=pdf_1&handle=euclid.pjm/1103038065

江南小竹,氤氲水墨

在小DNA分子们赛跑电泳的间隙,
过来上网找水墨竹子的图片。

希望要那种姿态挺拔的,
画面简洁,只有单根或者几根,
却又不要过于阳刚的水墨竹子。
会修改成timeline做网站导航用,配书法的logo,
大家给推荐一下?

网站design:
http://parts.mit.edu/igem07/index.php/Peking

June 25

打破语塞

好久不写Space,对文字都生疏了。提笔放笔,却不知如何落笔。想来想去,决定给大家概括一下我最近的状况吧:
 
bla#@!$完美主义$@$提质粒$bla##四风琴协奏曲$*(#神经生物学#阿三自传$@文科女生()*基督教教堂*()被欺负的波波兄!!神奇可爱的曦励姐姐(*)畅畅#·!可爱大道*GRE(台湾阳明大学事件(—candy(CCER8巴黎高科9Addy4lanry.s5(*&Renewable Energy Research*(&三人一对足*—(材料科学&*化学*(bla凸最优化*(北医3随性/公主vs女魔头...小兰姐#$高跟凉鞋*(88yyf!…
 
抱歉哦笔力不及。总之,还是很开心的:)
 
May 26

夏天

今天收到了msra的拒信
心中却充满了欣喜
因为收获了一个
属于我的,夏天

May 04

豆瓣收藏秀

读(看、听)过的书、电影、音乐、Blog
 
 
May 03

物理学的天才

物理学史上有四位天才。牛顿,使物理成为了科学;麦克斯韦,将物理推动到了经典的极致;爱因斯坦,用思想的力量颠覆了经典物理;而费曼,把处在理性巅峰上的物理带回了物质世界。有这样的荣耀,一生无憾。可是,今天的物理,褪去了百年前闪耀的理性光辉,只剩下与化学和生物等姊妹为伍,疲于应付纷繁的世界。动辄天价的实验仪器,成百上千的模型假说,只述说了当代物理的无奈。即便是纯粹的天文学,面对多过繁星、却又充斥着巨大误差的数据,也只能束手无策。
 
有观点说,由于数学的引入,化学和生物学正在变得更加精确,更接近于物理学。这恰恰是说反了。今天的物理学正在变得更加琐碎,更加依赖于唯象的拼凑,更加平庸。反而是物理学,正在接近化学和生物学的混沌状态。
 
下一位物理学天才,不必急于解开基本粒子的作用之谜,也不必急于解释清楚宇宙的起源。物理学需要的,是一位在对纷繁的物质世界的研究中,能指出一条道路的天才。这位天才,可能是一位物理学家,也可能是一位化学家、一位生物学家,甚至可能是一位深谙自然科学的哲学家。
February 26

记TILIP

长歌将尽,诚惶诚恐。念时跨八月,足踏三邦,行遍十四地。大海捞瓜,崇明长夜,西域盛舞。唯愿车公作美,怎奈好事多磨。
喜不自禁,雪山之南。继风尘仆仆,友人相助,过八大名校。鸿门盛宴,高谈阔论,中印崛起。惊悉叶氏好熊,如何是个变法?
 
零七年正月TILIP论坛结束之夜
 
My heartful thanks go to Vera, Sherman, Heather, all other team members and Qinglan.
February 23

An Incidence

I haven't expected my question would lead to such an incidence at the end of tonight's panel. Thanks Sophia for standing up for me when I was not ready to defend myself. I really appreciate that a lot.
 
Also thanks Richard for the calm and incisive comments afterwards. You addressed a key problem of me which needs to be overcome.
 
And sorry to TILIP if we lose our speaker next year.

听课

到这边来,听的第一堂课是Natalie的“生物工程实验导论”(这是我给起的名字,方便大家理解课的内容和性质),在MIT。我按照事先约好的时间,提前了十分钟到了课室。那是一间十米见宽的四方小房子,对半分开,前半边只在正中放一张木方桌(算是讲台),一侧靠边还有一条白色的长条小桌,后半边则都是可移动的学生座椅。让我觉得新奇的,便是那不成比例的大的教师空间,演戏都有余了。作图如下:
 
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*tt                                          *
*tt                tttttt                   *
*tt                tttttt                   *
*tt                                          *
w                                 c   c     *
w   c   c   c   c   c   c    c    c      *
w     c   c  c   c    c  c  c  c   c    *
w      c   c  c      c  c    c  c   c    d 
w     c   c    c    c c c     c  c  c   d
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    Rm 13-3095, MIT
 (图例:d 门, t 桌, c 椅, w 窗)
 
一个小时的实验课讲得颇为风趣,这且不谈,讲讲课的内容。整学期的实验课分为4个模块,好些实验都是第一次加入的,甚至只是MIT一两年前才研发出的技术。Drew后来跟我说,这大概算是MIT最好的课程之一了。随后的Biosynthesis Lunch Discussion也是别开生面(还是在MIT那座奇形怪状的生物楼里举行的)。
 
略去在MIT若干无趣的数学、物理讲座,转说Yale。我并未在Yale听什么讲座,倒是在物理系吃了一次下午茶。巧遇了一位南大的师姐,发现居然都认识老鲍。又与一位的来访的教授聊了好一会儿。讲到PKU的时候,他连连说“that's a good place to be from!想来PKU还是在Yale的声誉最好吧。
 
在West Point的课,讲美国政治,并无太多出彩之处。倒是那儿的学生给我的印象更深,有一股劲儿。
 
我的Princeton之行,虽然只有一个白天,却听到了三个喜欢的讲座,也着实察觉到了这座象牙塔尖的与种不同。一个物理的Seminar,只听得一群大牛对特定实验中数据拟合的方法——一个不经心就大可以忽略的枝节——讨论得不可开交。接下来应用数学研究所的报告,也是翔实确切,踏踏实实,明明白白,却亦不乏高瞻远瞩。之后还不小心撞到了一位物理诺贝尔奖得主宴请本科学生的晚餐座谈会。除了讲些物理八卦之外,他老人家还耐心的给我们讲解了两本书的目录,有意思。
 
回到Tufts,听过了两门“文科”的课。在彼地,听米国人讨论深圳、香港的女工,也颇有趣味呢!后一门课是美国军事,开课的居然是这儿一位大四的学生。加上还有个Institute for Global Leadership,每个寒假暑假都把学生往国外赶。难怪有人说Tufts是美国最trendy的学校之一。
 
我在军事课上介绍了中国大学生的军训。他们最不能接受的,便是在烈日底下站军姿。想起我们在West Point看到的军事训练,包括负重行走、格斗、缚手游泳等等,虽说更像是军训里该有的东西,却是不适合我们国情的。
February 22

2月IBM月度难题(翻译)

考虑如下二人游戏。两人各获得一个0-1之间均匀分布的随机变量,此时双方各自可选择接受此变量,或放弃并再获取一个新变量取代。当一方做出选择时,并不知对方变量的大小,也不知对方选择如何。接下来摊牌,数大者胜。问用怎样的策略才能保证至少50%的胜率?
 

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